来自塔林科技大学的研究人员 Grete Raba、Signe Adamberg 和 Kaarel Adamberg 表明，酸性环境会促进粪便细菌聚生体——微生物群从苹果果胶中产生丁酸。果胶是一种富含于苹果、浆果、水果和蔬菜中的膳食纤维。果胶用于果冻和甜点。由于人体消化酶不能降解果胶，它会被大肠的微生物代谢。该研究的主要结论发表在FEMS Microbiology Letters 上，是环境酸度 (pH) 对结肠细菌组成和代谢的重要性。然而，结肠的 pH 值与饮食密切相关。
含有大量全麦产品、蔬菜、水果和浆果的富含纤维的饮食有助于结肠细菌形成有益的代谢产物。众所周知的代谢物之一，丁酸，为肠道上皮细胞提供能量和营养，从而保护宿主免受炎症和感染。此外，膳食纤维可提高肠道转运率(食糜通过肠道的运动)并控制肠道的 pH 值。健康人的结肠 pH 值保持在 6 - 7 之间，而升高(更基本的 pH 值 > 7 - 8)的 pH 值与多种肠道疾病有关，例如肠易激综合征或结肠癌。
塔林科技大学的科学家在体外研究了 pH 值在 6 到 8 之间对复杂粪便微生物群落组成和代谢的影响.实验表明，在酸性环境(pH <6.5)下，产丁酸菌(Faecalibacterium prausnitzii 和 Coprococcus come)的生长显着增强。另一方面，在缺乏纤维的饮食中典型的碱性环境(pH > 7.5)下，微生物组成类似于疾病状态的特征：蛋白质降解细菌数量增加，产生更高含量的潜在有害物质。可以看出，某些细菌显然更喜欢更高的酸度，而其他细菌则更喜欢更碱性的环境。然而，一些分类群具有优越的适应性，可以在很宽的 pH 范围内生长。
细菌聚生体的动态很大程度上受底物的可用性控制。在目前的研究中，研究了果胶的具体作用，然而，真正的食物含有多种膳食纤维的混合物，对结肠微生物群有不同的影响。
作为一个重要的结果，作者观察到酸度对粘蛋白降解细菌动力学的显着影响。粘蛋白是覆盖肠上皮细胞的粘液层的主要成分。粘蛋白的持续分泌在血液循环和肠道之间起到保护层的作用。某些结肠细菌可以降解粘蛋白作为能源。因此，应控制粘蛋白降解细菌的数量以保持有效的保护功能。
除了酸度的影响外，在两种不同的稀释率下研究了细菌聚生体的变化，模拟了快速和缓慢的结肠转运率。观察到的主要差异是在缓慢稀释率下产生甲烷的物种丰度增加，这已被证明发生在结肠癌的情况下。反过来，快速稀释速率支持产生丁酸的细菌的生长。
Grete Raba、Signe Adamberg 和 Kaarel Adamberg 的研究证实了 pH 作为控制结肠微生物群生长和代谢的关键因素的重要性。
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