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已知的基因继续让研究人员感到惊讶

导读 人类基因组在大约 20 年前被测序。从那时起,编码我们蛋白质的序列信息是已知的——至少在原则上是这样。然而,这些信息并不是连续存储在

人类基因组在大约 20 年前被测序。从那时起,编码我们蛋白质的序列信息是已知的——至少在原则上是这样。然而,这些信息并不是连续存储在单个基因中,而是被分成更小的编码部分。这些编码部分,也称为外显子,在称为剪接的过程中组装。根据基因,不同的外显子组合是可能的,这就是它们被称为不同或替代剪接组合的原因。

几乎所有 20,000 个人类基因都可以进行选择性剪接。在大脑中发现了种类特别多的不同剪接变体,这允许创造巨大的多样性并使蛋白质适应特定要求。“然而,要确定实际存在哪些蛋白质变体并不容易,”Andreas Reiner 说。“已经拼接的信使 RNA (mRNA) 的测序,即所谓的 RNA-Seq 数据,现在越来越多地通过高通量方法获得,提供了一条出路。”Robin Herbrechter 和 Andreas Reiner 现在使用这些数据来获得所有离子型谷氨酸受体剪接变体的概览。

检测到新的谷氨酸受体变异

研究人员使用生物信息学方法将数十亿 mRNA 序列片段与基因组对齐,以重建单个剪接事件的频率。这种方法还使他们能够检测新的、以前未知的剪接变体。有不少惊喜:系统分析表明,在之前研究的模式生物小鼠和大鼠中发现的一些变异根本不会发生在人类身上,或者比之前假设的要少得多。

“在新发现的同种型中,有些特别令人兴奋,因为它们与以前已知的变体完全不同,因此可能具有新的功能,”Robin Herbrechter 说。这包括由 GluA4 AMPA 受体基因形成的蛋白质结构域,以及 delta 受体 1 (GluD1) 同种型的首次描述。虽然现在的重点将放在分析这些变体上,但还计划进行进一步的生物信息学分析,例如确定哪些细胞类型产生不同的剪接变体。

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