导读 了解基因调控区域中特定突变的作用-开启和关闭基因的DNA和RNA部分-对于揭示基因组的工作方式以及正常发育和疾病非常重要。但是,以系统的方
了解基因调控区域中特定突变的作用-开启和关闭基因的DNA和RNA部分-对于揭示基因组的工作方式以及正常发育和疾病非常重要。但是,以系统的方式研究这些调控区域中的多种突变是一项艰巨的任务。尽管细胞系和酵母菌取得了进展,但对活体动物的研究却很少,尤其是在大型种群中。
亥姆霍兹协会(MDC)的马克斯·德尔布吕克分子医学中心的实验和计算生物学家联手建立了一种方法,可以在多达一百万个细微蠕虫中诱发数千种不同的突变,并分析由此对蠕虫的物理特性产生的影响和功能。
博士Jonathan Froehlich表示:“对于细胞系,您缺少开发过程,许多细胞类型以及所有细胞类型之间的相互作用都影响基因调控。”柏林医学系统生物学研究所(BIMSB)的MDC基因调控元件系统生物学系统实验室的候选人,也是第一篇论文的第一作者。“我们现在可以真正在重要的环境中测试这些调控序列,并观察对生物体的影响。”
蠕虫遇见CRISPR-Cas9
微小的秀丽隐杆线虫蠕虫是研究人类基因调控过程的绝佳代理。“我们和他们是如此相似,”弗罗里希说。“它们有专门的组织,肌肉,神经,皮肤,肠道,生殖系统。对于基因调控研究,重要的是要拥有专门的细胞类型和发育。”
为了在大型秀丽隐杆线虫种群中有效诱导各种突变,研究人员转向了基因编辑工具CRISPR-Cas9。他们确定了最多10个被Cas9酶切割的DNA片段,而这些片段被RNA引导至这些斑点。但是研究人员没有发出任何其他指示,而是让生物体通过自然机制修复DNA断裂。这导致以遗传密码的缺失或插入形式出现的多种突变,称为“ indels”。
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