研究人员使用基于外泌体的策略来阻断小鼠的HIV限制技术材料对低碳转型的影响黑人女性患三阴性乳腺癌的风险增加了三倍常见抗生素可减少低出生体重和早产NIAID科学家发现丙型肝炎进入细胞的关键新的 125 万美元赠款使研究性激素在组织修复中的重要作用成为可能早产儿自动氧控装置临床试验检测研究人员利用人类干细胞构建胚胎样结构Wistar 科学家确定了预后不良的卵巢癌亚型的新治疗靶点哪些类型的大脑活动支持有意识的体验犹太医院接受新型人工心脏新技术提高了冷冻电子显微镜的清晰度和安全性统计建模为 DNA 折叠的统一理论指明了方向碳纤维电气测量为雷击保护技术铺平道路PAIN®中的研究报告称天气会影响疼痛耐受性少吃脂肪可以拯救你的头发唾液检测可以早期发现人乳头瘤病毒驱动的头颈癌活体肝移植对儿童有更好的结果正确的程序可以将免疫细胞变成癌症杀手开创性软件可以使用人工智能设计的纳米粒子生长和治疗虚拟肿瘤肯尼亚马加迪湖的记录表明地球轨道变化驱动的环境变化通过组织工程的新方法改善人类健康的研究蒙特利尔研究人员创造了一种生物打印神经元细胞的新方法研究人员在蒙大拿州发现四只恐龙加拿大的氮足迹显示出很大的区域差异左乳房放射治疗可使心脏病风险增加一倍研究表明坚持低脂乳制品可能不是唯一的心脏健康选择工程研究人员对二维超流体中涡旋的形成提出了新的解释CU研究人员授予NIH资助新中心研究自身免疫性疾病MIND饮食与更好的认知表现有关良好的睡眠时间恢复与更健康的饮食和减少饮酒有关吃植物性饮食引起的肠胃胀气增加表明肠道微生物群更健康高质量饮食与较低的偏头痛频率和严重程度有关肠道微生物是啤酒花化合物提供健康益处的关键地中海饮食可改善认知功能和记忆力研究表明善解人意的青少年来自更安全的家庭一项新研究将过量饮用咖啡与痴呆症风险增加联系起来运动和冥想可以在短短 10 分钟内帮助患有多动症的孩子研究发现心理干预可以成功治疗青少年的亚阈值抑郁症新的多样化研究揭示了参与ADHD治疗的六个阶段研究人员揭穿高药价是创新所必需的神话反义寡核苷酸疗法穿过血脑屏障PerkinElmer发布新的KRAS调查工具包2021年AI药物开发资金猛增研究人员发现可以使用新的计算机程序自动计算作为癌细胞标志物的微核用于骨科植入物的抗菌涂层可防止危险感染更高的波浪如何导致更多的冰云新西兰外海的深海生物多样性高于预期使用计算机辅助结肠镜检查可降低漏诊率研究人员在脑膜中发现的免疫系统 B 细胞
您的位置:首页>行业动态>

科学家将人类肠道微生物组的所有已知细菌基因组整理到一个大型数据库中

一个国际科学家团队已将来自人类肠道微生物组的所有已知细菌基因组整理到一个大型数据库中。他们的工作发表在《自然生物技术》上,将使研究人员能够探索细菌基因和蛋白质之间的联系,以及它们对人类健康的影响。

该项目由EMBL的欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)牵头,其中包括来自Wellcome Sanger研究所,特伦托大学,Gladstone研究所和美国能源部联合基因组研究所的合作者。

微生物多于人类细胞

细菌从内到外覆盖着人体。它们产生的蛋白质会影响我们的消化,我们的健康以及我们对疾病的敏感性。它们如此普遍,以至于人体中的微生物组中所包含的细胞(细菌,真菌和其他微生物)比人体细胞中的细胞要多。

为了了解细菌物种在人类生物学中的作用,科学家通常在对DNA进行测序之前先在实验室中对其进行分离和培养。但是,许多细菌会在实验室环境下无法重现的条件下壮成长。

为了获得有关此类物种的信息,研究人员采取了另一种方法:他们从环境中收集单个样本(在本例中是人类肠道),并对整个样本中的DNA进行测序。然后,他们使用计算方法从该单个样本中重建成千上万种物种的个体基因组。这种称为宏基因组学的方法为分离和测序单个物种的DNA提供了有力的替代方法。

人类肠道中的生物多样性

“去年,包括我们在内的三个独立团队重建了数千个肠道微生物组基因组。主要问题是这些团队是否具有可比的结果,以及我们是否可以将它们汇总到一个全面的清单中,” EMBL- EBI。

科学家现在已经从人类肠道中的4600多种细菌中编辑了20万个基因组和1.70亿个蛋白质序列。他们的新数据库,统一的人类胃肠道基因组集合和统一的胃肠道蛋白质目录,揭示了我们胆量的巨大多样性,为进一步的微生物组研究铺平了道路。

特伦托大学首席研究员尼古拉·塞加塔(Nicola Segata)解释说:“这一庞大的目录是微生物组研究的一个里程碑,对于科学家们来说,这是宝贵的资源,可以用来开始研究并希望了解每种细菌在人类肠道生态系统中的作用。”

该项目表明,实验室中从未培养出超过70%的被检测细菌,它们在人体中的活动仍然未知。属于该类别的最大细菌群是Comantemales,这是肠道菌的一种顺序,该菌群于2019年在EMBL Heidelberg的Bork集团领导的一项研究中首次描述。

芬恩团队的EMBL-EBI /桑格博士后研究员亚历山德·阿尔梅达(Alexandre Almeida)解释说:“看到同伴有多么广泛,真是令人惊讶。这突显了我们对肠道细菌的了解很少。”“我们希望我们的目录能够在未来几年内帮助生物信息学家和微生物学家弥合这一知识鸿沟。”

标签:

郑重声明:本文版权归原作者所有,转载文章仅为传播更多信息之目的,如作者信息标记有误,请第一时间联系我们修改或删除,多谢。