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FSU生物学家使用基因组数据库调查癌细胞

佛罗里达州立大学生物科学教授David Gilbert正在使用有关人类基因组的最新信息作为更好地了解癌症的指南。

Gilbert和他的FSU同事是一个团队的一部分,该团队使用他开发的一种新方法将不同癌细胞类型与正常人细胞数据库进行比较,该新方法可以识别出癌症来源的细胞类型。通过将各种癌细胞与正常细胞的集合进行比较,他们能够分辨出哪些癌症与不同细胞类型最接近。

吉尔伯特说:“癌细胞来自你体内的细胞,但是它们已经改变了。”“在评估复发患者的新肿瘤是起源于原始肿瘤还是完全是新癌症时,了解它们来自何种细胞类型特别重要。”

他们的工作发表在《自然通讯》上,是国际上为了解人类基因组如何工作而进行的一系列出版物的另一篇文章,该工作由国立卫生研究院资助,被称为DNA元素百科全书(ENCODE)。由于只有1%的人类DNA编码任何已知的蛋白质,因此了解我们基因组其余部分的功能一直是一个巨大的挑战。

吉尔伯特(Gilbert)和他的同事们还为《自然》杂志上出版的更大的《 ENCODE》出版物做出了贡献,总结了最新一轮的ENCODE资金投入。这项研究的重点是映射人类基因组中近一百万个元素,覆盖基因组的8%,以调节基因。就是说,它们决定了基因表达的数量以及在什么身体组织中表达。

吉尔伯特说:“生物体的复杂性并不在于它具有的蛋白质编码基因的数量。”“它是这些基因的组合。我们拥有与蠕虫和苍蝇几乎相同数量的基因,但我们以更复杂的组合表达它们。”

他的实验室在图片中添加了复制-DNA复制自身的过程。

他说:“人们通常不会将复制视为在不同细胞类型中受到不同调节的事物,因为所有细胞中的DNA都是相同的。”“但是,复制的不仅是DNA。DNA复制时,调节DNA的所有染色体成分都被完全分解并重新组装。我们已经证明,DNA复制片段的顺序对于每个细胞都是唯一的而且患病细胞的类型也不同。甚至对于特定患者的癌症而言也可能是唯一的。”

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